Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vmn1r46Q9EQ45 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vmn1r46Q9EQ45 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vmn1r46Q9EQ45 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vmn1r46Q9EQ45 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vmn1r46Q9EQ45 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vmn1r46Q9EQ45 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vmn1r46Q9EQ45 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vmn1r46Q9EQ45 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vmn1r46Q9EQ45 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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