Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc46a3Q9DC26 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc46a3Q9DC26 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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