Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Mrgpra3-201ENSMUST00000176369 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Pudp-201ENSMUST00000056460 1044 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Riok3Q9DBU3 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms