Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnn3Q9DAW9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms