Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms