Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd9Q9D9M4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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