Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx5Q9D8U8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx5Q9D8U8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx5Q9D8U8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Snx5Q9D8U8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Snx5Q9D8U8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Snx5Q9D8U8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Snx5Q9D8U8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Snx5Q9D8U8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Snx5Q9D8U8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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