Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lonrf3Q9D4H7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms