Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Spns3Q9D232 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Spns3Q9D232 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Spns3Q9D232 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms