Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms