Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Zbed3Q9D0L1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zbed3Q9D0L1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zbed3Q9D0L1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zbed3Q9D0L1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zbed3Q9D0L1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zbed3Q9D0L1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zbed3Q9D0L1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zbed3Q9D0L1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Zbed3Q9D0L1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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