Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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