Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sgo1Q9CXH7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sgo1Q9CXH7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Sgo1Q9CXH7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Sgo1Q9CXH7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Sgo1Q9CXH7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Sgo1Q9CXH7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Sgo1Q9CXH7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Sgo1Q9CXH7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Sgo1Q9CXH7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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