Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Xrcc3Q9CXE6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Xrcc3Q9CXE6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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