Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tdrd12Q9CWU0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms