Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snw1Q9CSN1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms