Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg12Q9CQY1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms