Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ifitm3Q9CQW9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ifitm3Q9CQW9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ifitm3Q9CQW9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ifitm3Q9CQW9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ifitm3Q9CQW9 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ifitm3Q9CQW9 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ifitm3Q9CQW9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ifitm3Q9CQW9 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms