Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ykt6Q9CQW1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms