Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccer1Q9CQL2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccer1Q9CQL2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccer1Q9CQL2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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