Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmed6Q9CQG0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmed6Q9CQG0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms