Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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