Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Use1Q9CQ56 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Use1Q9CQ56 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Use1Q9CQ56 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Use1Q9CQ56 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Use1Q9CQ56 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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