Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms