Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms