Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mrpl3Q99N95 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms