Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Mrpl43Q99N89 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl43Q99N89 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms