Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ms4a6cQ99N08 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms