Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrabdQ99JY4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms