Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lims1Q99JW4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms