Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim11aQ99J19 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms