Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ctu1Q99J10 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms