Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smc1bQ920F6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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