Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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