Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sft2d2Q8VD57 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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