Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubxn4Q8VCH8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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