Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Top1mtQ8R4U6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Top1mtQ8R4U6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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