Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxc12Q8K5B8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxc12Q8K5B8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxc12Q8K5B8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxc12Q8K5B8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxc12Q8K5B8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxc12Q8K5B8 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Hoxc12Q8K5B8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Hoxc12Q8K5B8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxc12Q8K5B8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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