Protein–RNA interactions for Protein: Q8K406

Lgi3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi3Q8K406 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lgi3Q8K406 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms