Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Prpf39Q8K2Z2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Prpf39Q8K2Z2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Prpf39Q8K2Z2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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