Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc12Q8K2L8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc12Q8K2L8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms