Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FgbQ8K0E8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms