Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Znf628Q8CJ78 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms