Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trip10Q8CJ53 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms