Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Upp2Q8CGR7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Upp2Q8CGR7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Upp2Q8CGR7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Upp2Q8CGR7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Upp2Q8CGR7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms