Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Brf1Q8CFK2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Brf1Q8CFK2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Brf1Q8CFK2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Brf1Q8CFK2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Brf1Q8CFK2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Brf1Q8CFK2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Brf1Q8CFK2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf1Q8CFK2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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