Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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