Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc178Q8CDV0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc178Q8CDV0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ccdc178Q8CDV0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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