Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Parp9Q8CAS9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp9Q8CAS9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms