Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dclre1bQ8C7W7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms